La generazione di cellule staminali pluripotenti indotte (iPSCs) da cellule di paziente è una delle tecnologie più promettenti per la medicina rigenerativa e per applicazioni nell’ ambito della bioingegneria dei tessuti in 3D. Le applicazioni includono la terapia sostitutiva di cellule e tessuti 3D in varie malattie, nell’invecchiamento e nelle lesioni croniche e acute. IPSCs derivate da cellule di pazienti con malattie genetiche sono utili per la generazione di organoidi in 3D che ricapitolano il fenotipo clinico specifico del paziente e quindi possono essere utilizzati per la modellazione della malattia, per studiarne i meccanismi di insorgenza e progressione e per allestire test farmacologici per valutare terapie farmacologiche strategiche prima del trattamento del paziente.

Stato del brevetto

DEPOSITATO

Numero di priorità

RM2014A000596

Data di priorità

21/10/2014

Licenza

INTERNAZIONALE

Mercato

La nostra invenzione ha potenziali applicazioni di mercato di uso immediato in ambito clinico, farmacologico e bio-ingegneristico, quali:
1. modellazione ex situ della malattia per studiarne i meccanismi di insorgenza e progressione e per identificazione di marcatori
2. applicazioni cliniche per la terapia sostitutiva cellulare o tissutale per pazienti con malattie croniche o lesioni acute
3. applicazioni farmacologiche in modelli di malattia ex situ a scopo di ricerca e per lo screening farmacologico di molecole che modulano TMEM230 per la medicina personalizzata e di precisione
4. applicazioni di bioingegneria per l’allestimento di co-colture e la generazione di organoidi artificiali in 3D per lo sviluppo di network tissutali
5. editing del genoma utilizzando tecnologie all'avanguardia come CRISPR/cas9

Problema

Le cellule di pazienti anziani possono essere entrate in senescenza a causa dell'età biologica del paziente o di gravi lesioni della cromatina o mutazioni e potrebbero essere difficili da riprogrammate in iPSC con caratteristiche cellulari simili a cellule embrionali, necessarie per applicazioni di medicina rigenerativa.
Le cellule che sono entrate in senescenza possono impedire la generazione di iPSC o limitarne sia il loro normale differenziamento sia l’attività funzionale dei tessuti. Queste cellule geneticamente aberranti o instabili possono anche acquisire proprietà di cellule staminali tumorali e possono mettere a rischio il paziente dopo la terapia di sostituzione cellulare.
L'uso di iPSC con aberrazioni genetiche oltre a mettere il paziente a rischio di cancro, genera anche un significativo onere economico per la società.
Proponiamo l'uso della proteina INT6-5A che, agendo sulla selezione e sull'arricchimento di iPSC con maggiore fedeltà di DNA, RNA e proteine, promuove e consente la riprogrammazione con alta efficienza di cellule difficili da riprogrammare come le cellule di pazienti in età avanzata.

Limiti attuali tecnologie / Soluzioni

(1) La riprogrammazione cellulare e l'editing del genoma CRISPR/cas dipendono dalla capacità delle cellule di proliferare. (2) Le lesioni genetiche presenti nelle cellule del paziente saranno spesso trasferite alle iPSC generate. Le lesioni genetiche e l'incapacità di proliferare sono associate a cellule di pazienti anziani o pazienti con malattie croniche, cancro e danni genetici.
Le cellule che sono entrate in senescenza a causa dell'età biologica del paziente o a causa di gravi lesioni della cromatina o mutazioni possono impedire la generazione di iPSC o limitare la loro normale differenziazione e la funzionalità dei tessuti.
Gravi lesioni della cromatina possono causare cellule geneticamente aberranti o instabili che possono acquisire caratteristiche di cellule staminali tumorali e possono mettere a rischio il paziente in seguito alla terapia di sostituzione cellulare, o alternativamente possono generare cloni iPS con limitata sopravvivenza.

Killer Application

Abbiamo convalidato che l'uso di RNA INT6-5A genera iPSC contenenti meno anomalie a livello di DNA e RNA rispetto ad iPSC ottenute con altri approcci di riprogrammazione, utilizzando cellule derivate dagli stessi pazienti.
Abbiamo generato organoidi 3D utilizzando iPSC generate da RNA INT6-5A per potenziali applicazioni nella medicina personalizzata, nella medicina rigenerativa, nella modellazione delle malattie e nella bioingegneria.
Abbiamo dimostrato l'uso di iPSC derivate da INT6-5A per generare organoidi 3D specifici del tessuto, inclusi reni e vasi sanguigni.
Le potenziali applicazioni client includono:
Applicazioni cliniche per la terapia sostitutiva cellulare o tissutale per pazienti con malattie croniche o lesioni acute.
Modelli ex situ per la ricerca dei meccanismi di malattia e per lo screening farmacologico nella medicina di precisione e personalizzata.Terapia cellulare sostitutiva per la medicina rigenerativa personalizzata

Modelli 3D di malattie umane paziente-specifici

Organoidi 3D paziente-specifici per screening farmacologico e terapie personalizzate.

Tecnologia e nostra soluzione

Abbiamo identificato INT6-5A, un nuovo gene umano che è una variante del fattore di inizio della traduzione EIF3E. L'approccio di riprogrammazione cellulare basato su mRNA INT6-5A migliora l'efficienza di riprogrammazione di cellule derivate da pazienti "difficili da riprogrammare".
La riprogrammazione delle cellule con RNA INT6-5A in combinazione con l'editing genetico CRISPR / cas9 basato su RNA genera iPSC umane clinicamente più sicure e con maggiore efficienza.
IPSC generate da cellule di pazienti anziani utilizzando approcci di riprogrammazione standard sono per la maggior parte inadatte all’utilizzo in clinica per la medicina rigenerativa a causa di aberrazioni genetiche (cloni rossi)
La riprogrammazione di cellule difficili da riprogrammare derivate da pazienti anziani mediata dall’RNA di INT6-5A si traduce in una maggiore efficienza nella generazione di colonie iPSC e in un numero di cloni iPSC con meno aberrazioni di DNA e RNA, rispetto a quelli generati con altri approcci di riprogrammazione.
INT6-5A funzione 1: Promuove la riprogrammazione cellulare riducendo il contenuto degli istoni. INT6-5A funzione 2:
promuove il rimodellamento della cromatina riducendo il contenuto di istoni. INT6-5A funzione 3: promuove il controllo di qualità di DNA, RNA e proteine durante riprogrammazione e replicazione cellulare regolando la risposta al danno al DNA, il decadimento mediato da RNA e la pioneer translation.

Vantaggi

INT6-5° aumenta l'efficienza della riprogrammazione di cellule senescenti o terminalmente differenziate derivate da paziente e difficili da riprogrammare in iPSC
INT6-5A seleziona positivamente iPSC clinicamente più sicure con DNA, RNA e molecole proteiche meno aberranti.
L'espressione transitoria di INT6-5A non trasforma le cellule sane in cellule tumorali poiché l'espressione transitoria dell'RNA INT6-5A, utilizzata per la riprogrammazione basata sull'RNA, non è oncogena.
La proliferazione cellulare e il rimodellamento della cromatina sono transitori quando l'espressione di INT6-5a è transitoria.
L'espressione transitoria di INT6-5A nelle cellule non determina un aumento del tasso di mutazione nelle colture cellulari a lungo termine o anomalie del cariotipo.
La riprogrammazione delle cellule del paziente basata su RNA INT6-5A è completamente compatibile con l'erogazione di RNA della tecnologia CRISPR Cas9

Roadmap

La potenziale roadmap per lo sviluppo industriale della tecnologia include:
applicazioni cliniche per la terapia sostitutiva cellulare o tissutale per pazienti con malattie croniche o lesioni acute.
applicazioni farmacologiche per modelli ex situ di malattia a scopo di ricerca e per lo screening farmacologico nella medicina di precisione e personalizzata.
applicazioni di bioingegneria per la generazione di organoidi e tessuti in 3D
editing del genoma di cellule riprogrammate INT6-5A, utilizzando tecnologie all'avanguardia come CRISPR/cas9.

Attività di interazione: gli inventori sono disposti a partecipare alla dimostrazione dell'uso della loro tecnologia, esplorando nuovi usi della loro tecnologia, sviluppando iPSC di grado clinico per applicazioni specifiche.

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